Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pnma1Q8C1C8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pnma1Q8C1C8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pnma1Q8C1C8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pnma1Q8C1C8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms