Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lrrd1Q8C0R9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lrrd1Q8C0R9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lrrd1Q8C0R9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lrrd1Q8C0R9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lrrd1Q8C0R9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Lrrd1Q8C0R9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Lrrd1Q8C0R9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Lrrd1Q8C0R9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Lrrd1Q8C0R9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrd1Q8C0R9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms