Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms