Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms