Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmod1Q8BVA4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmod1Q8BVA4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms