Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia2Q8BSS9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms