Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms