Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AknaQ80VW7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AknaQ80VW7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms