Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LnpkQ7TQ95 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LnpkQ7TQ95 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms