Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms