Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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Shq1Q7TMX5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Shq1Q7TMX5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Shq1Q7TMX5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Shq1Q7TMX5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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