Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms