Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms