Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NipblQ6KCD5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NipblQ6KCD5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NipblQ6KCD5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NipblQ6KCD5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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NipblQ6KCD5 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NipblQ6KCD5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NipblQ6KCD5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NipblQ6KCD5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NipblQ6KCD5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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