Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CltbQ6IRU5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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