Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg9bQ6EBV9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms