Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgd6Q69ZL1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgd6Q69ZL1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms