Protein–RNA interactions for Protein: Q64338

Pde1c, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1cQ64338 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pde1cQ64338 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pde1cQ64338 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pde1cQ64338 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pde1cQ64338 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pde1cQ64338 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pde1cQ64338 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pde1cQ64338 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pde1cQ64338 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pde1cQ64338 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1cQ64338 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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