Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms