Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Taf6Q62311 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Taf6Q62311 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Taf6Q62311 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Taf6Q62311 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Taf6Q62311 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Taf6Q62311 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms