Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms