Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SnrpaQ62189 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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