Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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