Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ecm1Q61508 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ecm1Q61508 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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