Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msi1Q61474 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msi1Q61474 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msi1Q61474 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msi1Q61474 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msi1Q61474 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msi1Q61474 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Msi1Q61474 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Msi1Q61474 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msi1Q61474 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msi1Q61474 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msi1Q61474 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Msi1Q61474 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msi1Q61474 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms