Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik1Q60934 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grik1Q60934 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms