Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csnk2a1Q60737 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnk2a1Q60737 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms