Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samhd1Q60710 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms