Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms