Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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