Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Esf1Q3V1V3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Esf1Q3V1V3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Esf1Q3V1V3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Esf1Q3V1V3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Esf1Q3V1V3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms