Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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