Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serac1Q3U213 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms