Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Specc1lQ2KN98 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms