Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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Shroom4Q1W617 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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Shroom4Q1W617 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Shroom4Q1W617 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Shroom4Q1W617 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Shroom4Q1W617 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms