Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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