Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam171bQ14CH0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms