Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne7Q0VE82 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms