Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms