Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pglyrp4Q0VB07 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms