Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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