Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms