Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms