Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms