Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cab39Q06138 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cab39Q06138 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cab39Q06138 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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