Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top1Q04750 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms