Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nf1Q04690 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nf1Q04690 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Nf1Q04690 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Nf1Q04690 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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