Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd1Q04519 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms