Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnd1Q03719 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnd1Q03719 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms