Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd1Q01822 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd1Q01822 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd1Q01822 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd1Q01822 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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